На рисунке кожицы чешуи лука видны продолговатые клетки, плотно прилегающие одна к другой. Каждая клетка имеет плотную прозрачную оболочку, в которой местами есть более тонкие участки – поры. Под оболочкой находится живое бесцветное вязкое вещество – цитоплазма. Цитоплазма медленно движется. При сильном нагревании и замораживании она разрушается, и тогда клетка погибает.

В цитоплазме находится небольшое плотное тельце – ядро, в котором можно различить ядрышко. С помощью электронного микроскопа было установлено, что ядро клетки имеет очень сложное строение.

Почти во всех клетках, особенно в старых, хорошо заметны полости – вакуоли (от лат. - пустой). Они заполнены клеточным соком. Клеточный сок – это вода с растворёнными в ней сахарами и другими органическими и неорганическими веществами. В клеточном соке могут содержаться красящие вещества, придающие синюю, фиолетовую, малиновую окраску лепесткам и другим органам растений. Осенняя окраска листьев также обусловлена окрашенным клеточным соком. Разрезая спелый плод или другую сочную часть растения, мы повреждаем клетки, и из их вакуолей вытекает сок.

В цитоплазме растительной клетки находятся многочисленные мелкие тельца – пластиды. При большом увеличении пластиды хорошо видны. В клетках разных органов растений число их различно.

У цветковых растений пластиды бывают зеленые, жёлтые или оранжевые и бесцветные. В клетках кожицы чешуи лука пластиды бесцветные. От цвета пластид и от красящих веществ, содержащихся в клеточном соке, зависит окраска тех или иных частей растений.

Зеленые пластиды называют хлоропластами. Окраска, форма и размеры клеток разных органов растений очень разнообразны.